分裂していた間の北朝の天皇は、光厳天皇ー光明天皇ー崇光天皇ー後光厳天皇ー後圓融天皇です。

南朝の天皇は後醍醐天皇（96代）ー後村上天皇 （97代）ー長慶天皇（98代）ー後亀山天皇 （99代）です。

南朝の天皇が歴代天皇として数えられています。これは、徳川光圀が編纂した「大日本史」が南朝を正当な皇室と認識していたため、この考えを受け継いだ明治政府も南朝を支持したからです。

議会でも議論（南北朝正閏論）が行われ紛糾しますが、最終的に明治天皇が南朝の正当性を認めたことで決定しました。